(1)中台八葉院之中央赤色蓮花中畫有九尊，大日如來之四方及四隅八葉之尊，表四佛四菩薩；前東是寶幢如來表大圓鏡智，南方開敷花王如來表平等性智，西方阿彌陀如來表妙觀察智，北方天鼓雷音如來表成所作智。以修行而言，四佛以東南西表示因行証入以上之四果位，四隅之菩薩表示因位上之 四行。果位上之菩薩即普賢、文殊、彌勒、觀音。
(2)持明院在中台八葉之下，經云：佛之持明使者，故得名。此院有五尊名五大院。此院西南隅畫有不動，西北隅有降三世，此二大明王外加畫有金剛呼迦羅、大威德明王、般若菩薩三尊。
(3) 遍知院在中台之上方(東位)，有三角火焰形，表一切如來之智印，中有般若佛母、七俱胝佛母，故又名佛母院。中台八葉表解脫道，此院表勝進道。主伴共有七尊。
(4)金剛手院，在中台之南方，因有發心者金剛薩埵住中央，故名金剛手院。此院有三十三尊主伴，中央五尊為主尊。
(5)觀音院亦名蓮花部院，位於中台八葉之北方，觀自在菩薩在中央。此院主尊有二十一尊，伴尊十五，共三十六尊。
(6)釋迦院在遍知院之上方(東位)，以變化身釋迦為坐中央。
~以上為第一重曼荼羅~
(7)文殊院位於第二重，此第二重有文殊院、除蓋障院、地藏院、虛空藏院、蘇悉地院之五院，是象徵開見內重大日如來三無盡莊嚴實相者，使吾人得以証悟而向上之曼荼羅。文殊院表示開悟實相之妙慧，以文殊為主尊，有二十五尊主伴。
(8)除蓋障院是在文殊院開悟了三無盡莊嚴的結果。蓋障德菩薩不住中央而住最下，表示已離主伴執著，共九尊。
(9)地藏院位於南方，表示得到除蓋障德的結果，不但能接受大法及堪受各種迫害，能以苦為樂。此院除地藏尊外，還畫有八菩薩。地者心地，藏者藏識，八尊是八識，本尊一識是總，數為九識。
(10)虛空藏院位於持明院西方，以虛空藏菩薩為主尊，共有二十八尊。
(11)蘇悉地院在虛空藏院之下方，初虛空藏院與蘇悉地院並未分開，後來再分開。此院畫有八尊蘇悉地菩薩為主體。
(12)外金剛院乃是護持密教之八方諸天，有四天、十二宮、二十八宿、九曜、八部等，共成為二百五尊。
(13)四重圓壇之意義，上述之胎藏曼荼羅，由左右各三重，前後四重所組成。『大日經』所說之曼荼羅是前後左右三重，即以『大日經』之核心，以表達因、根、究竟三句，中台與第一重 - 遍知、持明、觀音、金剛手，表菩提心之德，第二重 - 釋迦、文殊、虛空藏、蘇悉地、地藏、除蓋障六院表大悲之德，第三重 - 外金剛部院，表方便之德，此由三身，法、報、應而建立之曼荼羅。然今之曼荼羅是四重建立而成，左右與『大日經』相同，但上方有釋迦、文殊二院，下方有虛空藏，蘇悉地二院，共分四重，乃依四身四立之法來建立者，第一重是自性法身，第二重是受用身，第三重是變化身，第四重是等流身，配合而成。四重圓壇乃大日如來為引誘四機而流現之曼荼羅。行者之修行以至成佛階級分為三劫十地等四種，四重圓壇是要攝化四種之機來建立的。

金剛界曼荼羅
胎藏界是宇宙萬物的辯證顯現；金剛界是其智用順序，自眾生因位昇進到佛果位，各會之會就是因緣組織法。兩部即是宇宙，亦是佛 果性起之活動方式，諸尊之功德加持互相涉入而成佛，這就是眾生相之另一面。